眼科于2009年經軍區批準升級成立眼科中心，成為解放軍九五醫院重點發展的科室該中心現引進有日本NIDEK EC5000CXII準分子激光系統，且采用亞洲人角膜數據庫，比一些歐美設備更適合亞洲人使用，是目前最先進的眼科手術設備另。

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醫院一般的門診是不用預約的，只有專家門診時間有限，需要掛號預約。