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下設第一醫(yī)學中心原內科外科臨床部，醫(yī)技部門診部第二醫(yī)學中心原南樓臨床部第三醫(yī)學中心原武警總醫(yī)院第四醫(yī)學中心原304臨床部第五醫(yī)學中心原302307醫(yī)院第六醫(yī)學中心原海軍總醫(yī)院。

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通過“細分學科”的研究和應用，耳鼻咽喉專科在鼻炎鼻竇炎咽喉炎耳鳴耳聾中耳炎鼾癥等微創(chuàng)技術得到大幅提升，使武警上海總隊醫(yī)院耳鼻喉科成為全國行業(yè)治療領域的佼佼者，也使得耳鼻咽喉科形成自己獨特和不可替代的。

中國人民武裝警察部隊總醫(yī)院武警總醫(yī)院和中國人民武裝警察部隊總醫(yī)院是同義詞，已合并武警總醫(yī)院為近年來新崛起的一所集醫(yī)療保健教學科研為一體的大型現代化綜合性三級甲等醫(yī)院設置專業(yè)科室71個，配有各類設備總價值逾6億元，擁有。